Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm23273-201ENSMUST00000104058 135 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hdac9Q99N13 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hdac9Q99N13 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hdac9Q99N13 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hdac9Q99N13 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hdac9Q99N13 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hdac9Q99N13 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hdac9Q99N13 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hdac9Q99N13 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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Hdac9Q99N13 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hdac9Q99N13 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hdac9Q99N13 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hdac9Q99N13 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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Hdac9Q99N13 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hdac9Q99N13 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hdac9Q99N13 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hdac9Q99N13 Pik3c2g-209ENSMUST00000187618 2023 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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Hdac9Q99N13 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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Hdac9Q99N13 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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Hdac9Q99N13 Ube2v2-204ENSMUST00000118236 893 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Hdac9Q99N13 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Hdac9Q99N13 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hdac9Q99N13 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hdac9Q99N13 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hdac9Q99N13 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hdac9Q99N13 Rpl31-ps24-201ENSMUST00000181350 379 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hdac9Q99N13 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hdac9Q99N13 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hdac9Q99N13 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hdac9Q99N13 Trav7-5-201ENSMUST00000200609 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hdac9Q99N13 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hdac9Q99N13 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hdac9Q99N13 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hdac9Q99N13 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hdac9Q99N13 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hdac9Q99N13 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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