Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm5943-201ENSMUST00000119458 459 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Apobec3Q99J72 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms