Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 AC154677.1-201ENSMUST00000227636 2805 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Mir6537-201ENSMUST00000184150 110 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Zfp638-206ENSMUST00000203324 3822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 AC131677.1-201ENSMUST00000218721 535 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 1700097M23Rik-201ENSMUST00000204079 1522 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Olfr613-201ENSMUST00000106888 5139 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 5830444F18Rik-201ENSMUST00000194009 1992 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm14401-201ENSMUST00000108968 247 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm12458-201ENSMUST00000119387 495 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Vmn1r181-201ENSMUST00000181796 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm3086-202ENSMUST00000221248 310 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Olfr1109-201ENSMUST00000099863 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Btbd35f17-201ENSMUST00000105014 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 4930451E10Rik-201ENSMUST00000130840 409 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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Usp19Q3UJD6 Gm22156-201ENSMUST00000158409 141 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm27773-201ENSMUST00000184087 78 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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Usp19Q3UJD6 Zfp950-210ENSMUST00000205854 466 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Mir215-201ENSMUST00000083628 112 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Olfr353-203ENSMUST00000217215 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Sult6b1-204ENSMUST00000169544 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm5757-201ENSMUST00000117494 528 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp19Q3UJD6 Gm14549-201ENSMUST00000154993 1035 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms