Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Rap1gapos-201ENSMUST00000135358 471 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm4487-201ENSMUST00000150617 442 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm22398-201ENSMUST00000174941 125 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm25731-201ENSMUST00000175167 125 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm25481-201ENSMUST00000083221 158 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 n-R5s54-201ENSMUST00000083837 112 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm6902-202ENSMUST00000191169 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Olfm3-201ENSMUST00000051309 3928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm2093-201ENSMUST00000180518 3526 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 1700097M23Rik-201ENSMUST00000204079 1522 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm16290-201ENSMUST00000161175 474 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Vmn2r-ps122-201ENSMUST00000176687 906 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm26944-201ENSMUST00000182265 633 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm37603-201ENSMUST00000192368 219 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm45029-201ENSMUST00000208702 391 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm34779-201ENSMUST00000210036 263 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Ly6a-201ENSMUST00000023248 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Olfr38-202ENSMUST00000215796 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Efhc2-201ENSMUST00000026014 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Shroom4Q1W617 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Shroom4Q1W617 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Shroom4Q1W617 Ddx3y-201ENSMUST00000091190 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Shroom4Q1W617 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Shroom4Q1W617 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Shroom4Q1W617 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Shroom4Q1W617 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Shroom4Q1W617 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Shroom4Q1W617 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Shroom4Q1W617 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Shroom4Q1W617 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Shroom4Q1W617 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Shroom4Q1W617 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Shroom4Q1W617 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Shroom4Q1W617 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Shroom4Q1W617 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Shroom4Q1W617 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Shroom4Q1W617 Rpl31-ps13-201ENSMUST00000060994 378 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Shroom4Q1W617 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Shroom4Q1W617 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Shroom4Q1W617 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Shroom4Q1W617 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Shroom4Q1W617 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Shroom4Q1W617 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Shroom4Q1W617 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Shroom4Q1W617 Olfr711-201ENSMUST00000051715 3035 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms