Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Dst-202ENSMUST00000097786 17212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Vmn1r72-202ENSMUST00000209638 6501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Mir6899-201ENSMUST00000184798 64 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 AI506816-203ENSMUST00000198461 503 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm45659-201ENSMUST00000209295 564 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 n-R5s3-201ENSMUST00000083879 112 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Olfr2-203ENSMUST00000208147 6178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Olfr665-203ENSMUST00000216257 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Fsd1l-207ENSMUST00000180164 7340 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm12190-201ENSMUST00000120001 187 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm16250-201ENSMUST00000148974 256 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm25923-201ENSMUST00000158312 138 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Mir7074-201ENSMUST00000183884 63 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm29668-201ENSMUST00000187802 315 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 AC154239.2-201ENSMUST00000227859 233 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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