Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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ptchd1Q14B62 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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ptchd1Q14B62 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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ptchd1Q14B62 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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ptchd1Q14B62 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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ptchd1Q14B62 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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ptchd1Q14B62 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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ptchd1Q14B62 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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ptchd1Q14B62 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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ptchd1Q14B62 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ptchd1Q14B62 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.3 ms