Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm22156-201ENSMUST00000158409 141 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm17416-201ENSMUST00000163724 201 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 A930005H10Rik-202ENSMUST00000185424 433 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm44032-201ENSMUST00000204841 166 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Olfr414-202ENSMUST00000192358 4526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 4932429P05Rik-201ENSMUST00000113958 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 1700017N19Rik-210ENSMUST00000218464 1597 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm11448-201ENSMUST00000120427 450 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Llph-ps2-201ENSMUST00000122000 393 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Olfr453-201ENSMUST00000053647 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Nlrp2-201ENSMUST00000045022 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Neat1-201ENSMUST00000173672 20771 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm8666-201ENSMUST00000117517 292 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Olfr1269-203ENSMUST00000216493 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm4631-202ENSMUST00000121393 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Cep290-206ENSMUST00000219765 7985 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Olfr646-202ENSMUST00000214099 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Zfp850-203ENSMUST00000180502 6163 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm23226-201ENSMUST00000116927 103 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm24224-201ENSMUST00000158828 258 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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