Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
VdrP48281 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
VdrP48281 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
VdrP48281 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
VdrP48281 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
VdrP48281 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
VdrP48281 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
VdrP48281 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
VdrP48281 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
VdrP48281 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
VdrP48281 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
VdrP48281 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
VdrP48281 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
VdrP48281 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
VdrP48281 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
VdrP48281 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
VdrP48281 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
VdrP48281 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
VdrP48281 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
VdrP48281 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
VdrP48281 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
VdrP48281 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Vmn2r-ps2-201ENSMUST00000121053 765 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Mir1946a-201ENSMUST00000158360 134 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm7726-201ENSMUST00000206241 231 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Olfr580-ps1-201ENSMUST00000210528 943 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
VdrP48281 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
VdrP48281 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms