Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr112-204ENSMUST00000208832 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Cntn6-205ENSMUST00000162872 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr1277-202ENSMUST00000214760 5944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Dach2-202ENSMUST00000113378 2089 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm6205-202ENSMUST00000190001 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Abi3bp-204ENSMUST00000171000 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Cul4b-203ENSMUST00000115118 3344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm22498-201ENSMUST00000104497 86 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm12112-201ENSMUST00000117772 231 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Rpl27-ps2-201ENSMUST00000120378 399 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm26028-201ENSMUST00000158660 294 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm43730-201ENSMUST00000199863 372 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr354-202ENSMUST00000217479 9539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 AC165164.2-201ENSMUST00000220313 392 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 AC154635.1-201ENSMUST00000221433 400 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 AC154738.2-201ENSMUST00000227403 1110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr969-201ENSMUST00000074566 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Nap1l1-202ENSMUST00000171797 3926 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Nap1l1-204ENSMUST00000218828 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Vmn1r62-201ENSMUST00000173956 1757 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 2310001H17Rik-203ENSMUST00000181517 3981 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 C230031I18Rik-201ENSMUST00000197856 3698 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr330-202ENSMUST00000213188 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Mmrn1-203ENSMUST00000204333 4472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Vmn2r19-201ENSMUST00000073948 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Ecm2-201ENSMUST00000051504 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Cp-205ENSMUST00000108329 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 4933436I01Rik-201ENSMUST00000026325 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Trav12d-2-201ENSMUST00000103593 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Trav12n-2-201ENSMUST00000103619 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Xlr5a-202ENSMUST00000114520 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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