Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprkP35822 P2ry14-205ENSMUST00000197220 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm17067-201ENSMUST00000166837 3673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprkP35822 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm3239-201ENSMUST00000163525 1751 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm7497-201ENSMUST00000183064 1003 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm29704-201ENSMUST00000196011 253 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm36259-201ENSMUST00000197340 392 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm42451-201ENSMUST00000197410 244 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Olfr1498-ps1-201ENSMUST00000208721 991 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm45086-201ENSMUST00000209052 462 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm3972-201ENSMUST00000173960 2861 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Efhc2-201ENSMUST00000026014 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Cd28-201ENSMUST00000027165 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
PtprkP35822 AL589737.1-201ENSMUST00000221163 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
PtprkP35822 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Olfr1131-203ENSMUST00000216756 1459 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm43260-201ENSMUST00000197378 2430 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprkP35822 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Igkv14-118-2-201ENSMUST00000198287 339 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Igkv14-126-1-201ENSMUST00000199899 346 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm6929-201ENSMUST00000210930 468 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprkP35822 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Nlrp4e-201ENSMUST00000076470 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Vmn1r52-207ENSMUST00000228394 3069 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Zfp583-206ENSMUST00000165705 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PtprkP35822 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm17829-201ENSMUST00000219782 344 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PtprkP35822 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Zfp595-201ENSMUST00000109735 3896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PtprkP35822 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PtprkP35822 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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