Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm10487-201ENSMUST00000177566 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Tppp2-202ENSMUST00000177625 627 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm14632-202ENSMUST00000177917 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm10058-202ENSMUST00000178152 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm10096-201ENSMUST00000178672 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm10230-202ENSMUST00000178745 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm2092-201ENSMUST00000178887 639 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm10147-202ENSMUST00000178966 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm2759-201ENSMUST00000179938 639 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm38149-201ENSMUST00000191943 339 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 AC158807.1-201ENSMUST00000217959 187 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Tsx-201ENSMUST00000033691 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Sycp2-201ENSMUST00000081134 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Ceacam3-201ENSMUST00000108491 3261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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RxraP28700 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Mbd3l1-202ENSMUST00000213625 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 AC123705.2-201ENSMUST00000221653 2009 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr1307-201ENSMUST00000099604 15582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Fam169a-202ENSMUST00000169863 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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