Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm6929-201ENSMUST00000210930 468 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 1700010D01Rik-201ENSMUST00000096366 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd4P10628 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm14927-201ENSMUST00000120283 454 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm25294-201ENSMUST00000122791 104 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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