Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 AC158142.1-201ENSMUST00000226721 416 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm45033-201ENSMUST00000206710 3167 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123 ms