Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr993-201ENSMUST00000099926 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5248-201ENSMUST00000186108 4046 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uty-205ENSMUST00000143286 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22135-201ENSMUST00000158752 108 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24224-201ENSMUST00000158828 258 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15796-201ENSMUST00000162135 204 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19503-201ENSMUST00000187109 241 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36259-201ENSMUST00000197340 392 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40608-201ENSMUST00000213692 654 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s7-201ENSMUST00000083755 121 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rian-201ENSMUST00000180876 8089 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5798-201ENSMUST00000164613 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 4932415D10Rik-202ENSMUST00000217661 15111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp984-202ENSMUST00000122309 2405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26367-201ENSMUST00000104165 132 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24788-201ENSMUST00000104283 156 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24067-201ENSMUST00000104514 85 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12465-201ENSMUST00000118591 300 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23215-201ENSMUST00000178153 121 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r181-201ENSMUST00000181796 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43449-201ENSMUST00000202955 371 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC158523.1-201ENSMUST00000221398 328 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 5830444F18Rik-201ENSMUST00000194009 1992 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43913-201ENSMUST00000203924 3029 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153522.2-201ENSMUST00000218389 3853 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154548.1-201ENSMUST00000225844 3838 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1309-203ENSMUST00000214935 5448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam26a-201ENSMUST00000049577 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14062-201ENSMUST00000134795 4134 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r74-202ENSMUST00000228471 6608 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13335-201ENSMUST00000129994 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4842-201ENSMUST00000183237 835 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms