Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm37936-201ENSMUST00000194647 1322 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm8666-201ENSMUST00000117517 292 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Olfr1159-ps1-201ENSMUST00000117651 913 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Tmc4-ps-201ENSMUST00000117819 258 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm8200-201ENSMUST00000122390 222 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Spin2-ps4-201ENSMUST00000126395 762 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm10059-201ENSMUST00000131139 171 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Spin2-ps3-201ENSMUST00000148147 762 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm24505-201ENSMUST00000157682 126 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm26036-201ENSMUST00000158149 144 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Pagr1a-201ENSMUST00000162069 422 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm27222-201ENSMUST00000183398 427 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 AC154239.2-201ENSMUST00000227859 233 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Dynap-201ENSMUST00000025390 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm43178-201ENSMUST00000197257 1386 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Macf1-205ENSMUST00000106220 17608 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 4930451E10Rik-201ENSMUST00000130840 409 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm25908-201ENSMUST00000157624 98 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Mir6345-201ENSMUST00000184286 128 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm28267-201ENSMUST00000191093 265 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm31717-201ENSMUST00000213044 668 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Olfr482-201ENSMUST00000081184 972 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 n-R5s151-201ENSMUST00000083959 119 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm10256-201ENSMUST00000179404 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Ckap5-204ENSMUST00000111338 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Scgb2b6-201ENSMUST00000188132 330 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 AC154738.1-201ENSMUST00000227054 368 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clrn2B2RVW2 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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