Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Primpol-201ENSMUST00000040468 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Cd28-201ENSMUST00000027165 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Cdr1-201ENSMUST00000166381 2313 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm15866-201ENSMUST00000149048 785 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm29387-201ENSMUST00000189074 623 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm37209-201ENSMUST00000194109 1276 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm11251-201ENSMUST00000119593 2800 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm23014-201ENSMUST00000104144 130 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Crem-219ENSMUST00000140332 1015 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Magea9-ps-201ENSMUST00000140655 732 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm24507-201ENSMUST00000157683 134 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Magea9-ps-202ENSMUST00000167328 899 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm4842-201ENSMUST00000183237 835 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Olfr864-ps1-201ENSMUST00000212664 930 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Olfr661-201ENSMUST00000098168 964 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Olfr819-202ENSMUST00000216322 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Olfr367-ps-202ENSMUST00000143957 942 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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