Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm28994-201ENSMUST00000188556 621 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Zfp931-202ENSMUST00000108924 962 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Ear10-202ENSMUST00000163652 471 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
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Rabgef1Q9JM13 Gm43601-201ENSMUST00000196294 945 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
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Rabgef1Q9JM13 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
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