Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1311-202ENSMUST00000213602 2631 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Olfr616-201ENSMUST00000106886 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm6214-201ENSMUST00000178845 541 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm45499-201ENSMUST00000211656 280 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Wfdc17-201ENSMUST00000092836 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm11251-201ENSMUST00000119593 2800 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Igkv12-98-201ENSMUST00000103327 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Gm24855-201ENSMUST00000104848 97 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Gm27940-201ENSMUST00000184449 98 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Gm37021-201ENSMUST00000195835 663 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Gm45659-201ENSMUST00000209295 564 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Gm35552-201ENSMUST00000214355 396 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 AC153975.1-201ENSMUST00000220087 926 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 B130011K05Rik-201ENSMUST00000151765 3270 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Gm10521-201ENSMUST00000097466 2574 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Zfp989-202ENSMUST00000146688 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cnga3Q9JJZ8 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms