Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Olfr826-203ENSMUST00000216661 2858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm3665-201ENSMUST00000177214 2461 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps51-201ENSMUST00000177271 2461 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Olfr810-202ENSMUST00000214206 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Nlrp4e-201ENSMUST00000076470 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Vmn1r43-205ENSMUST00000228709 12646 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Olfr1440-208ENSMUST00000217062 7484 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Neb-202ENSMUST00000036934 22489 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm12237-201ENSMUST00000120158 470 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm10059-201ENSMUST00000131139 171 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 1700092C17Rik-201ENSMUST00000135792 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm2182-201ENSMUST00000145243 663 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm40477-202ENSMUST00000221505 881 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm33958-201ENSMUST00000222879 450 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Krtap31-2-201ENSMUST00000058761 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Olfr476-201ENSMUST00000077249 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Mir202-201ENSMUST00000083568 72 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm37407-201ENSMUST00000194793 1316 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Olfr91-202ENSMUST00000216376 3832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Olfr145-202ENSMUST00000213688 6691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Ecm2-201ENSMUST00000051504 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm14124-201ENSMUST00000109922 3018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm11448-201ENSMUST00000120427 450 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm21742-201ENSMUST00000189352 548 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm37900-201ENSMUST00000195510 3805 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm44376-201ENSMUST00000197570 128 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm9616-201ENSMUST00000221154 781 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 AC165283.1-201ENSMUST00000223390 307 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 AY358078-201ENSMUST00000053821 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm42991-201ENSMUST00000196468 3837 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 AC154313.1-201ENSMUST00000217755 3841 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Olfr1197-202ENSMUST00000213118 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Chrna1os-201ENSMUST00000125413 680 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm26992-201ENSMUST00000182089 468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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