Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm18913-201ENSMUST00000204311 1789 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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Ubxn4Q8VCH8 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm15243-201ENSMUST00000151101 382 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ubxn4Q8VCH8 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms