Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 C430039J01Rik-201ENSMUST00000205973 957 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 AC158142.1-201ENSMUST00000226721 416 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Nlrp14-201ENSMUST00000084763 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Vmn1r215-202ENSMUST00000228092 2790 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm28154-201ENSMUST00000186267 4218 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Igkv4-69-201ENSMUST00000103349 348 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm15553-201ENSMUST00000118757 430 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Cfap97-206ENSMUST00000164504 4521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Rgs5-201ENSMUST00000027997 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm14325-201ENSMUST00000108939 1576 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm5938-201ENSMUST00000114030 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm45029-201ENSMUST00000208702 391 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Olfr998-201ENSMUST00000052307 1012 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm7381-201ENSMUST00000098958 300 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Olfr716-207ENSMUST00000216871 4062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Kctd12b-202ENSMUST00000112572 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm13386-201ENSMUST00000117677 124 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Defa-ps9-201ENSMUST00000118264 276 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 9430018G01Rik-201ENSMUST00000203260 3758 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Btbd35f23-201ENSMUST00000189190 1943 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Olfr32-205ENSMUST00000215659 2998 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm27392-201ENSMUST00000185041 101 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm11982-201ENSMUST00000121480 314 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm43586-201ENSMUST00000195948 310 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Mir34b-201ENSMUST00000083558 84 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Olfm3-201ENSMUST00000051309 3928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm6205-202ENSMUST00000190001 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Smt3h2-ps4-201ENSMUST00000121569 288 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 9130015L21Rik-201ENSMUST00000140319 606 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
NischQ80TM9 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms