Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Gabra3-202ENSMUST00000114554 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 5830444F18Rik-201ENSMUST00000194009 1992 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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Sh3bp2Q06649 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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Sh3bp2Q06649 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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Sh3bp2Q06649 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Gm11351-201ENSMUST00000139335 583 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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Sh3bp2Q06649 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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Sh3bp2Q06649 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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Sh3bp2Q06649 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Rpl26-ps5-201ENSMUST00000122220 439 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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