Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Ugp2-202ENSMUST00000102875 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Olfr1016-202ENSMUST00000216425 2698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm5347-201ENSMUST00000210542 2327 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm14875-201ENSMUST00000120881 319 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm15962-201ENSMUST00000124184 750 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm15767-202ENSMUST00000153786 544 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm45710-201ENSMUST00000212847 215 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 AC132384.13-201ENSMUST00000219556 1159 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 AC141884.1-201ENSMUST00000226327 636 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Eif1-ps1-201ENSMUST00000086606 330 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm7452-202ENSMUST00000202891 3039 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Olfr64-201ENSMUST00000081748 5001 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Olfr133-204ENSMUST00000215549 2944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Txndc9-204ENSMUST00000193832 3472 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 4931408C20Rik-201ENSMUST00000097801 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Olfr1196-203ENSMUST00000216977 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Olfr128-202ENSMUST00000216440 3644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm21850-201ENSMUST00000179792 359 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm26895-201ENSMUST00000181295 619 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm44054-201ENSMUST00000203814 372 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 AC147615.1-201ENSMUST00000218914 441 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 AC123705.4-202ENSMUST00000221602 697 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm37742-201ENSMUST00000193263 3979 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr213-202ENSMUST00000220008 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Ccr1-201ENSMUST00000026911 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr1269-203ENSMUST00000216493 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Cfap97-206ENSMUST00000164504 4521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms