Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Mbd3l1-202ENSMUST00000213625 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm3086-202ENSMUST00000221248 310 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 AC154635.1-201ENSMUST00000221433 400 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Zfp266-202ENSMUST00000174462 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Olfr1498-ps1-201ENSMUST00000208721 991 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 AC117656.3-205ENSMUST00000224606 1205 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Mir99a-201ENSMUST00000083596 65 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Zfp458-204ENSMUST00000225772 3485 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm13477-201ENSMUST00000121620 2687 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm11673-201ENSMUST00000117846 331 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxc11P31313 Gm13471-201ENSMUST00000122057 433 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms