Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Igkv12-98-201ENSMUST00000103327 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm24008-201ENSMUST00000157733 138 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprmP28828 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm37601-201ENSMUST00000194922 394 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm36971-201ENSMUST00000195244 378 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprmP28828 AC132465.3-201ENSMUST00000219326 195 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprmP28828 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Fam205c-202ENSMUST00000107978 1451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Vmn1r215-202ENSMUST00000228092 2790 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm12062-201ENSMUST00000117533 259 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gm20773-201ENSMUST00000178940 681 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Mir7676-1-201ENSMUST00000183491 62 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Mir7676-2-201ENSMUST00000183523 62 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gm44389-201ENSMUST00000203795 182 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PtprmP28828 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PtprmP28828 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Olfr38-202ENSMUST00000215796 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Olfr1231-202ENSMUST00000216144 3961 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gm2123-201ENSMUST00000221476 2836 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Mpc1-ps-201ENSMUST00000181662 330 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprmP28828 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gm42842-201ENSMUST00000197736 3004 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Olfr1501-203ENSMUST00000215350 4395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gm7241-201ENSMUST00000159853 357 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gm27392-201ENSMUST00000185041 101 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gm44779-201ENSMUST00000206937 708 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gm3565-201ENSMUST00000222670 609 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 n-R5s151-201ENSMUST00000083959 119 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprmP28828 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gm43260-201ENSMUST00000197378 2430 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprmP28828 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprmP28828 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprmP28828 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PtprmP28828 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms