Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Rian-211ENSMUST00000182737 699 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm18011-201ENSMUST00000203717 565 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC154635.1-201ENSMUST00000221433 400 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC154738.1-201ENSMUST00000227054 368 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RxraP28700 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Olfr1309-201ENSMUST00000207885 964 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm17752-201ENSMUST00000185787 3726 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RxraP28700 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
RxraP28700 Zfp37-202ENSMUST00000129511 1691 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
RxraP28700 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm14819-202ENSMUST00000169396 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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