Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Olfr638-201ENSMUST00000209757 966 ntAPPRIS P2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm46401-202ENSMUST00000223425 803 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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