Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r143-201ENSMUST00000171622 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Olfr653-202ENSMUST00000215585 4765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Olfr653-203ENSMUST00000217466 4786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm38152-201ENSMUST00000195389 3566 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Olfr19-202ENSMUST00000206365 1967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm36971-201ENSMUST00000195244 378 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm37397-201ENSMUST00000194579 2842 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm17106-201ENSMUST00000105610 459 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm12392-201ENSMUST00000118014 938 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm21850-201ENSMUST00000179792 359 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm27564-201ENSMUST00000185196 96 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Olfr469-201ENSMUST00000075704 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm42842-201ENSMUST00000197736 3004 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gnpnat1-206ENSMUST00000227468 1490 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r39-206ENSMUST00000228651 2144 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Cnga3Q9JJZ8 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153 ms