Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Pign-201ENSMUST00000070699 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Zfp984-202ENSMUST00000122309 2405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Ralgapa1-211ENSMUST00000220367 7473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm26367-201ENSMUST00000104165 132 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm13232-201ENSMUST00000121816 632 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm12708-201ENSMUST00000126143 349 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm10059-201ENSMUST00000131139 171 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Ugt2a2-202ENSMUST00000144144 929 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm13923-201ENSMUST00000153283 288 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm22211-201ENSMUST00000158097 156 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm5258-201ENSMUST00000165437 327 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Olfr151-201ENSMUST00000211893 1128 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 AC174459.2-201ENSMUST00000226036 160 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Olfr1507-203ENSMUST00000206062 2803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Vmn2r26-201ENSMUST00000032238 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm25726-201ENSMUST00000104529 129 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 1700092C17Rik-201ENSMUST00000135792 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm15767-202ENSMUST00000153786 544 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm28612-201ENSMUST00000189214 416 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm5876-201ENSMUST00000203735 243 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Olfr1501-202ENSMUST00000208493 4230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm42616-201ENSMUST00000198989 4184 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm38057-201ENSMUST00000195551 3203 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm42946-201ENSMUST00000196108 2570 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Ube2v2-204ENSMUST00000118236 893 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Cyp2j7-ps2-201ENSMUST00000119189 179 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SgshQ9EQ08 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.8 ms