Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm21856-201ENSMUST00000187547 696 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm46190-201ENSMUST00000219650 427 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 AC123705.4-202ENSMUST00000221602 697 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Crem-202ENSMUST00000049942 953 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm38057-201ENSMUST00000195551 3203 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm17752-201ENSMUST00000185787 3726 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Cntn6-201ENSMUST00000089215 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Vmn2r26-201ENSMUST00000032238 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Cybb-201ENSMUST00000015484 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm13386-201ENSMUST00000117677 124 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm12760-201ENSMUST00000117861 482 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm15780-201ENSMUST00000121283 935 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm23677-201ENSMUST00000083156 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Olfr360-202ENSMUST00000216706 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm38104-201ENSMUST00000195121 1895 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Dync2h1-204ENSMUST00000140466 14264 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Vmn1r172-201ENSMUST00000038694 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Nell1os-203ENSMUST00000152166 410 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm22968-201ENSMUST00000157955 118 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 A630095N17Rik-202ENSMUST00000180101 571 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm37050-201ENSMUST00000193464 466 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 AC154239.2-201ENSMUST00000227859 233 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms