Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Hmgb1-ps5-201ENSMUST00000121058 557 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r103-201ENSMUST00000163461 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm16490-201ENSMUST00000165299 351 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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Sgo1Q9CXH7 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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Sgo1Q9CXH7 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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Sgo1Q9CXH7 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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Sgo1Q9CXH7 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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Sgo1Q9CXH7 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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Sgo1Q9CXH7 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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Sgo1Q9CXH7 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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Sgo1Q9CXH7 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Mid2-203ENSMUST00000112993 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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