Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ddb2Q99J79 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ddb2Q99J79 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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Ddb2Q99J79 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ddb2Q99J79 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Ddb2Q99J79 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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Ddb2Q99J79 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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Ddb2Q99J79 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ddb2Q99J79 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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Ddb2Q99J79 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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Ddb2Q99J79 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Ddb2Q99J79 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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Ddb2Q99J79 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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Ddb2Q99J79 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ddb2Q99J79 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ddb2Q99J79 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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Ddb2Q99J79 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ddb2Q99J79 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ddb2Q99J79 Gm45507-201ENSMUST00000210611 519 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ddb2Q99J79 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Ddb2Q99J79 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Ddb2Q99J79 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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