Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Olfr495-202ENSMUST00000215215 2460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm15021-201ENSMUST00000117832 742 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm7257-201ENSMUST00000041537 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm25773-201ENSMUST00000116718 127 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Olfr1159-ps1-201ENSMUST00000117651 913 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm5473-201ENSMUST00000179326 642 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Apobec3Q99J72 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms