Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 1700097M23Rik-201ENSMUST00000204079 1522 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm42616-201ENSMUST00000198989 4184 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Llph-ps2-201ENSMUST00000122000 393 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm22453-201ENSMUST00000122801 318 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm43735-201ENSMUST00000198245 809 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 AC159809.1-201ENSMUST00000216235 520 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Xirp2-202ENSMUST00000112347 11979 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 C2cd6-201ENSMUST00000097080 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm43649-201ENSMUST00000196596 391 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Rpl18a-ps2-201ENSMUST00000197158 174 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Arl2bp-203ENSMUST00000211858 318 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm3086-202ENSMUST00000221248 310 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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Atg4aQ8C9S8 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm23464-201ENSMUST00000083145 147 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Fat3-205ENSMUST00000217308 18760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm14549-201ENSMUST00000154993 1035 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 A930005H10Rik-202ENSMUST00000185424 433 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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