Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm18585-201ENSMUST00000215197 556 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Vmn1r39-206ENSMUST00000228651 2144 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm23014-201ENSMUST00000104144 130 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm12112-201ENSMUST00000117772 231 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm22383-201ENSMUST00000158188 327 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm23023-201ENSMUST00000158767 109 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm45052-201ENSMUST00000206457 405 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Olfr205-201ENSMUST00000074125 990 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Olfr695-201ENSMUST00000216868 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Aadacl2-201ENSMUST00000169794 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Fat3-205ENSMUST00000217308 18760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm8569-201ENSMUST00000117630 647 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm21850-201ENSMUST00000179792 359 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm27976-201ENSMUST00000183635 162 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm27564-201ENSMUST00000185196 96 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm45209-201ENSMUST00000207122 353 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms