Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm43197-201ENSMUST00000201493 2583 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm4724-201ENSMUST00000109045 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Rps29P62274 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Olfr653-202ENSMUST00000215585 4765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Olfr653-203ENSMUST00000217466 4786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Vmn1r22-202ENSMUST00000227650 3674 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Ifi208-202ENSMUST00000169857 1767 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Olfr118-203ENSMUST00000216551 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Dst-203ENSMUST00000115104 23279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm28168-201ENSMUST00000191265 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Pik3ca-201ENSMUST00000029201 8917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm14308-201ENSMUST00000108990 1628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Olfr1316-202ENSMUST00000213696 4184 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm24281-201ENSMUST00000104234 136 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm24318-201ENSMUST00000104490 131 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm24067-201ENSMUST00000104514 85 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Vmn1r-ps2-201ENSMUST00000118464 834 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm12252-201ENSMUST00000119517 219 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm9003-201ENSMUST00000121810 482 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 n-R5s45-201ENSMUST00000122592 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm15949-201ENSMUST00000129485 126 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm23905-201ENSMUST00000157568 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm25386-201ENSMUST00000157814 288 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm17951-201ENSMUST00000198536 496 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Klk1b18-ps-201ENSMUST00000205780 167 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm23518-201ENSMUST00000082835 153 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Mir504-201ENSMUST00000093602 79 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm45792-201ENSMUST00000207795 4268 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Vmn2r38-201ENSMUST00000108554 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm45176-201ENSMUST00000207696 4096 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Olfr1196-203ENSMUST00000216977 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Olfr959-202ENSMUST00000215194 4339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Olfr782-202ENSMUST00000213970 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Olfr330-202ENSMUST00000213188 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Zfp616-201ENSMUST00000074813 5014 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 CAAA01194877.1-201ENSMUST00000213137 4233 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 AC124572.2-201ENSMUST00000218041 5152 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 4931408C20Rik-201ENSMUST00000097801 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Vmn1r74-202ENSMUST00000228471 6608 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Vmn1r14-205ENSMUST00000227884 7542 ntAPPRIS P2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Olfr148-202ENSMUST00000216801 2775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Gm14401-201ENSMUST00000108968 247 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rps29P62274 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms