Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm45533-201ENSMUST00000210295 165 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprmP28828 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Mup14-201ENSMUST00000071005 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprmP28828 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprmP28828 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Vmn1r52-207ENSMUST00000228394 3069 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprmP28828 AC154548.1-201ENSMUST00000225844 3838 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Vmn2r26-201ENSMUST00000032238 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm3454-201ENSMUST00000185571 412 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm32381-201ENSMUST00000203192 476 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprmP28828 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Zfp583-206ENSMUST00000165705 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Cntn6-205ENSMUST00000162872 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Btbd35f23-201ENSMUST00000189190 1943 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm12276-201ENSMUST00000121709 301 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm14473-201ENSMUST00000122269 557 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtprmP28828 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm17829-201ENSMUST00000219782 344 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtprmP28828 AC127270.2-201ENSMUST00000221337 247 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm8231-201ENSMUST00000221617 783 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm46401-202ENSMUST00000223425 803 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtprmP28828 AC130547.1-201ENSMUST00000228079 1047 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Nlrp4f-201ENSMUST00000037372 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtprmP28828 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtprmP28828 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm37733-201ENSMUST00000195478 2962 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm32444-201ENSMUST00000195147 3511 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm14369-201ENSMUST00000121355 285 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Smt3h2-ps4-201ENSMUST00000121569 288 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprmP28828 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm37239-201ENSMUST00000193510 141 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Olfr330-202ENSMUST00000213188 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm22890-201ENSMUST00000158642 144 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprmP28828 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm7041-201ENSMUST00000201227 524 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprmP28828 4930598N05Rik-201ENSMUST00000207048 550 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gm45420-201ENSMUST00000211243 425 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprmP28828 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Olfr998-201ENSMUST00000052307 1012 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Gpm6a-201ENSMUST00000033915 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtprmP28828 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms