Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RhoP15409 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RhoP15409 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RhoP15409 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RhoP15409 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RhoP15409 AC117656.3-205ENSMUST00000224606 1205 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RhoP15409 Tsx-201ENSMUST00000033691 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RhoP15409 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RhoP15409 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RhoP15409 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RhoP15409 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RhoP15409 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RhoP15409 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RhoP15409 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RhoP15409 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RhoP15409 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RhoP15409 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RhoP15409 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm14979-201ENSMUST00000121561 1035 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Cyp3a25-202ENSMUST00000138870 513 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Magea9-ps-201ENSMUST00000140655 732 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm26085-201ENSMUST00000157900 116 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Magea9-ps-202ENSMUST00000167328 899 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm19709-201ENSMUST00000215403 482 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 AC122937.1-201ENSMUST00000226405 793 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm22578-201ENSMUST00000083730 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm3089-201ENSMUST00000200804 1395 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RhoP15409 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RhoP15409 Olfr1501-203ENSMUST00000215350 4395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RhoP15409 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RhoP15409 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RhoP15409 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RhoP15409 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RhoP15409 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RhoP15409 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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