Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm2056J3QQ02 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm2056J3QQ02 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm2056J3QQ02 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm2056J3QQ02 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm2056J3QQ02 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm2056J3QQ02 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm2056J3QQ02 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm2056J3QQ02 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm2056J3QQ02 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm2056J3QQ02 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Gm2056J3QQ02 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Gm2056J3QQ02 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Gm2056J3QQ02 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm2056J3QQ02 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Gm2056J3QQ02 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm2056J3QQ02 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm2056J3QQ02 1700023F02Rik-203ENSMUST00000189619 473 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Gm2056J3QQ02 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Gm2056J3QQ02 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Gm2056J3QQ02 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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Gm2056J3QQ02 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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Gm2056J3QQ02 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Gm2056J3QQ02 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Gm2056J3QQ02 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Gm2056J3QQ02 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm25294-201ENSMUST00000122791 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm28241-201ENSMUST00000190916 235 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm2056J3QQ02 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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