Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm18442-201ENSMUST00000220925 639 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm6054-201ENSMUST00000078052 378 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Gm28038F7BCN9 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms