Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm12392-201ENSMUST00000118014 938 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm2182-201ENSMUST00000145243 663 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm26085-201ENSMUST00000157900 116 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm45052-201ENSMUST00000206457 405 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 9330132A10Rik-201ENSMUST00000059118 3727 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Cd84-205ENSMUST00000155802 3291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm15738-201ENSMUST00000131985 275 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm38825-201ENSMUST00000204022 648 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Prune2-201ENSMUST00000087689 12512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Grik3B1AS29 Olfr695-201ENSMUST00000216868 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms