Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Atad1-201ENSMUST00000070210 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Mir1251-201ENSMUST00000175486 84 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 CU024892.1-201ENSMUST00000224869 515 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Cd28-201ENSMUST00000027165 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm42566-201ENSMUST00000197120 643 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm40658-203ENSMUST00000222210 1070 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Lipo5-201ENSMUST00000156818 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Olfr695-201ENSMUST00000216868 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm26418-201ENSMUST00000104275 137 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Trpc5Q9QX29 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms