Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Olfr476-201ENSMUST00000077249 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm23093-201ENSMUST00000083450 102 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gabra3-202ENSMUST00000114554 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm4758-201ENSMUST00000114851 291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm26988-201ENSMUST00000183296 945 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
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Rabgef1Q9JM13 Gm24268-201ENSMUST00000082990 110 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Epyc-201ENSMUST00000020094 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm42537-201ENSMUST00000198260 2574 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm14927-201ENSMUST00000120283 454 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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