Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm37625-201ENSMUST00000194969 4872 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Themis-202ENSMUST00000060409 2278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm42946-201ENSMUST00000196108 2570 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Jmjd1c-206ENSMUST00000173689 8609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm14303-201ENSMUST00000121320 171 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps134-201ENSMUST00000176907 1046 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 1700113H08Rik-203ENSMUST00000189775 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm43635-201ENSMUST00000202533 352 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 CU024892.1-201ENSMUST00000224869 515 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 AC122397.2-201ENSMUST00000227422 686 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 AC164437.2-201ENSMUST00000228915 797 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Fabp9-201ENSMUST00000029038 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Apoo-ps-201ENSMUST00000061241 586 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Ddx3y-201ENSMUST00000091190 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 1700097M23Rik-201ENSMUST00000204079 1522 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Neto2-201ENSMUST00000109686 5610 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Pkhd1l1-203ENSMUST00000209244 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm23014-201ENSMUST00000104144 130 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Clec1b-203ENSMUST00000112081 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm24636-201ENSMUST00000158673 288 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm37601-201ENSMUST00000194922 394 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Vmn1r46-202ENSMUST00000205088 10770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Phf11c-201ENSMUST00000166912 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Vmn2r48-201ENSMUST00000165611 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Vmn2r51-201ENSMUST00000094863 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Olfr715b-202ENSMUST00000215713 3879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm11673-201ENSMUST00000117846 331 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm12719-201ENSMUST00000118859 241 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm5258-201ENSMUST00000165437 327 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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