Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1269-202ENSMUST00000214404 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm10340-201ENSMUST00000170790 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm5943-201ENSMUST00000119458 459 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Junos-205ENSMUST00000130684 614 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm6650-201ENSMUST00000166710 614 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm44649-201ENSMUST00000205608 364 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1090-201ENSMUST00000099875 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Olfr613-202ENSMUST00000214173 3840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Rpusd4Q9CWX4 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms