Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm9017-201ENSMUST00000159613 676 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 AC122508.1-201ENSMUST00000218365 233 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Olfr1148-201ENSMUST00000077580 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm28994-201ENSMUST00000188556 621 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm18867-201ENSMUST00000198022 1179 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Fam20bQ8VCS3 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.7 ms