Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Atg4aQ8C9S8 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Atg4aQ8C9S8 Cntn6-205ENSMUST00000162872 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm13348-201ENSMUST00000147324 690 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r143-201ENSMUST00000171622 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 CT030170.6-201ENSMUST00000221149 550 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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Atg4aQ8C9S8 AC150560.2-201ENSMUST00000227208 171 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Olfr819-202ENSMUST00000216322 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm37192-201ENSMUST00000194479 1348 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm26019-201ENSMUST00000104407 119 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm26371-201ENSMUST00000157829 104 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm24224-201ENSMUST00000158828 258 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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Atg4aQ8C9S8 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm21742-201ENSMUST00000189352 548 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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Atg4aQ8C9S8 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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Atg4aQ8C9S8 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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Atg4aQ8C9S8 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r171-203ENSMUST00000226321 3067 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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Atg4aQ8C9S8 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm43730-201ENSMUST00000199863 372 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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Atg4aQ8C9S8 Mir215-201ENSMUST00000083628 112 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 n-R5s151-201ENSMUST00000083959 119 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Ralgapa1-211ENSMUST00000220367 7473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Zfp72-202ENSMUST00000223163 4153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atg4aQ8C9S8 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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