Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm14399-201ENSMUST00000099029 192 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm25313-201ENSMUST00000101817 116 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm23287-201ENSMUST00000179427 116 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm23143-201ENSMUST00000180137 116 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 1700109I08Rik-201ENSMUST00000185680 396 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm32975-201ENSMUST00000211651 584 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm24871-201ENSMUST00000083099 116 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Rnu5g-201ENSMUST00000093721 116 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Neat1-201ENSMUST00000173672 20771 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Hmcn1-201ENSMUST00000074783 17908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Olfr560-201ENSMUST00000210453 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Olfr397-202ENSMUST00000213134 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm3835-201ENSMUST00000120752 403 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm15738-201ENSMUST00000131985 275 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm37961-201ENSMUST00000192729 299 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Trim71Q1PSW8 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms