Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 CT009711.3-201ENSMUST00000225882 250 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Olfr1116-201ENSMUST00000090717 924 ntAPPRIS P2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Vmn1r46-204ENSMUST00000228231 13338 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm42843-201ENSMUST00000196328 3616 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 A230057D06Rik-202ENSMUST00000207061 3717 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Olfr365-203ENSMUST00000218602 5374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Lrrtm2-201ENSMUST00000091636 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Rmi1-202ENSMUST00000224479 4212 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Pde1a-205ENSMUST00000102654 4122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Dock11-202ENSMUST00000115264 1725 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Vmn2r48-201ENSMUST00000165611 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Olfr716-207ENSMUST00000216871 4062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Olfr148-202ENSMUST00000216801 2775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm15553-201ENSMUST00000118757 430 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm13170-201ENSMUST00000119716 643 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm6650-201ENSMUST00000166710 614 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Mir6938-201ENSMUST00000184173 63 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm28550-201ENSMUST00000189125 618 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm28460-202ENSMUST00000190590 618 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Synpr-207ENSMUST00000223583 3362 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Ptprz1-201ENSMUST00000090568 8068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Zfp352-201ENSMUST00000080541 1656 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Olfr729-202ENSMUST00000213163 4283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Oog2-201ENSMUST00000080405 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Olfr1356-202ENSMUST00000205100 3023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm42486-201ENSMUST00000200369 3486 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gpr34-202ENSMUST00000096492 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm15058-201ENSMUST00000117689 458 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rpl28P41105 Gm10059-201ENSMUST00000131139 171 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms