Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Olfr801-204ENSMUST00000216067 4014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm25447-201ENSMUST00000158997 128 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm37603-201ENSMUST00000192368 219 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm23736-201ENSMUST00000082553 75 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Olfr1311-202ENSMUST00000213602 2631 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Olfr406-203ENSMUST00000217016 2651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 CAAA01194877.1-201ENSMUST00000213137 4233 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Clec2f-201ENSMUST00000121051 374 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm22314-201ENSMUST00000158007 281 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm25438-201ENSMUST00000158281 110 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm16290-201ENSMUST00000161175 474 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Mir6914-201ENSMUST00000184999 69 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Vmn1r80-201ENSMUST00000075053 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm9911-201ENSMUST00000211467 2802 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprkP35822 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm12173-201ENSMUST00000117622 273 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm26036-201ENSMUST00000158149 144 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm24636-201ENSMUST00000158673 288 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm5258-201ENSMUST00000165437 327 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm36964-201ENSMUST00000191876 198 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm17887-201ENSMUST00000200194 547 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprkP35822 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprkP35822 AC150560.2-201ENSMUST00000227208 171 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Gm24147-201ENSMUST00000082763 144 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprkP35822 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprkP35822 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Gm37830-201ENSMUST00000195282 837 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Gm44099-201ENSMUST00000203299 112 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PtprkP35822 AC131677.1-201ENSMUST00000218721 535 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Gm29774-201ENSMUST00000219270 436 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PtprkP35822 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtprkP35822 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Gm11692-201ENSMUST00000122121 902 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Gm13852-201ENSMUST00000122350 242 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Gm24850-201ENSMUST00000158029 119 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtprkP35822 Gm43635-201ENSMUST00000202533 352 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtprkP35822 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PtprkP35822 AC154576.1-201ENSMUST00000225864 563 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms